Los cambios en el file de la tarjeta SD no activan las aplicaciones para actualizar

Recientemente he movido mi repository git a una tarjeta SD siempre conectada, formateada para OS X Extended. He notado que tanto SourceTree como WebStorm ya no se dan count de los cambios en el file. Se pone realmente molesto cuando restablece los files desde la command-line, realiza algunos cambios y luego cuando va a save ese file, WebStorm se queja de que el file ha cambiado.

Editar:

Nueva información encontrada, esto realmente parece ser un problema con enlaces simbólicos. Cuando moví mis proyectos a la nueva tarjeta SD, hice un enlace simbólico en mi directory personal a la tarjeta SD, porque tengo algunos scripts configurados para esperar eso. Esto también vino con la conveniencia de que los marcadores del proyecto de WebStorm simplemente funcionarían también. Cuando eliminé el marcador anterior e hice uno nuevo en la location de la tarjeta SD todo está funcionando como se esperaba.

Entonces, la nueva pregunta es, ¿es esto solo una limitación de enlaces simbólicos en OS X, o hay algo que puedo hacer para combatir esto?